Автоматически апдейты - это удобно. Однако, если в системе установлены и скомпилированы некоторые пакеты с источниками, не поддерживающимися в стандартных репозиториях Ubuntu, таких как например eAccelerator, автоматические апдейты могут привести к неработоспособности системы, устраняемой только лишь перекомпиляцией данных пакетов, и, соответственно, требующих человеческого участия. По закону подлости, это может произойти именно тогда, когда Вы находитесь в другом городе и т.п.

Итак, вот что нужно сделать, чтобы отключить функцию автоматических апдейтов.

В файле:

/etc/apt/apt.conf.d/50unattended-upgrades

// Automatically upgrade packages from these (origin, archive) pairs
Unattended-Upgrade::Allowed-Origins {
//        "Ubuntu hardy-security";
//      "Ubuntu hardy-updates";
};